Der Cranio-Sacralen-Therapie liegt die Annahme einer engen Wechselbeziehung zum Nerven-, Gefäß- und Lymphsystem sowie zum Hormon-, Atmungs-, Muskel- und Skelettsystem zu Grunde.
Innerhalb des Gehirns wird die Gehirnflüssigkeit rhytmisch freigesetzt, die sich als Druckwelle über das Rückenmark bis zum Kreuzbein (Sacrum) fortsetzt. Diesen Impuls nennt man
Cranio-Sacralen-Rhythmus, der von einem Therapeuten sensibel erspürt und behandelt wird.